Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fbxo48Q8CAT8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms