Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4930507D05RikQ8C9C9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms