Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scara3Q8C850 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms