Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp20Q8C6M1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Usp20Q8C6M1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp20Q8C6M1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp20Q8C6M1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp20Q8C6M1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp20Q8C6M1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp20Q8C6M1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp20Q8C6M1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp20Q8C6M1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp20Q8C6M1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp20Q8C6M1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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