Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Bhlhe22Q8C6A8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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