Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C5C9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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