Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4X2

Csnk1g3, Casein kinase I isoform gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1g3Q8C4X2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnk1g3Q8C4X2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk1g3Q8C4X2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk1g3Q8C4X2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnk1g3Q8C4X2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g3Q8C4X2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g3Q8C4X2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g3Q8C4X2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g3Q8C4X2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g3Q8C4X2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g3Q8C4X2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk1g3Q8C4X2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms