Protein–RNA interactions for Protein: Q8C116

Fmo9, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo9Q8C116 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fmo9Q8C116 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fmo9Q8C116 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms