Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nek11Q8C0Q4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek11Q8C0Q4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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