Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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FarsaQ8C0C7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FarsaQ8C0C7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FarsaQ8C0C7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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