Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ccser1Q8C0C4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ccser1Q8C0C4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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