Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms