Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3dQ8BX13 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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