Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms