Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Suds3Q8BR65 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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