Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ7

Cgrrf1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cgrrf1Q8BMJ7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cgrrf1Q8BMJ7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms