Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Susd6Q8BGE4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd6Q8BGE4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms