Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms