Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms