Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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IfneQ80ZF2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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IfneQ80ZF2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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IfneQ80ZF2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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IfneQ80ZF2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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IfneQ80ZF2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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IfneQ80ZF2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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IfneQ80ZF2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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IfneQ80ZF2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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IfneQ80ZF2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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IfneQ80ZF2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IfneQ80ZF2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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IfneQ80ZF2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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