Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo1Q80ZD8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms