Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc2Q80W04 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms