Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms