Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
NischQ80TM9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NischQ80TM9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms