Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf8Q80TJ7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf8Q80TJ7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf8Q80TJ7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms