Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms