Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctdp1Q7TSG2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms