Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek5Q7TSC3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms