Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2lQ7TS74 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms