Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sbno2Q7TNB8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sbno2Q7TNB8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sbno2Q7TNB8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sbno2Q7TNB8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms