Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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