Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn4bQ7M729 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn4bQ7M729 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn4bQ7M729 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scn4bQ7M729 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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