Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cspg5Q71M36 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cspg5Q71M36 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cspg5Q71M36 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cspg5Q71M36 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cspg5Q71M36 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cspg5Q71M36 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms