Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ncapd3Q6ZQK0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ncapd3Q6ZQK0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms