Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd4Q6ZPR5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd4Q6ZPR5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms