Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssx9Q6XAS3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssx9Q6XAS3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms