Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc88cQ6VGS5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms