Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms