Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6PD19 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6PD19 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6PD19 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6PD19 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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