Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Zbtb40Q6PCS8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Zbtb40Q6PCS8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Zbtb40Q6PCS8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Zbtb40Q6PCS8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Zbtb40Q6PCS8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zbtb40Q6PCS8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Zbtb40Q6PCS8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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