Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atl2Q6PA06 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms