Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgb4Q6P8W9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgb4Q6P8W9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms