Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac10Q6P3E7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac10Q6P3E7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms