Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms