Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdm2bQ6P1G2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kdm2bQ6P1G2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kdm2bQ6P1G2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kdm2bQ6P1G2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kdm2bQ6P1G2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdm2bQ6P1G2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdm2bQ6P1G2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdm2bQ6P1G2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms