Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx4Q6P1D7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slx4Q6P1D7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms