Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms