Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms