Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NipblQ6KCD5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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