Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms